而在北京的这一段时间，也是房峰辉“政绩”最突出的一段时间。在房峰辉担任北京军区司令员期间，先后领导军区部队持续开展实战化训练、提升信息化条件下作战能力、完成了奥运安保、国庆阅兵、国际维和等重大军事任务。

针对这一事件，中国外交部发言人陆慷在11日例行记者会上回答记者提问时表示，“根据中方掌握的情况，今天上午日本海上自卫队两艘舰艇先后进入赤尾屿东北一侧毗连区活动。中国海军对日方活动实施了全程跟踪监控。目前日方舰艇已经离开了有关毗连区”。

《三峡渔民退捕后新生活:从"靠江吃江"到"守江护江"》房峰辉一直出任参谋系统主官。从作训参谋，团参谋长，师参谋长，原新疆军区副参谋长，广州军区参谋长。2007年，房峰辉调任北京军区司令员，大军区正职。这时，房峰辉才56岁。他是“文革”结束后历任北京军区司令员最年轻的一位，也是当时的七大军区司令员中年纪最轻的一位。之后的党的十七大上，房峰辉当选为中央委员。